Cilvēka prāts ir sarežģīta sistēma. Tādēļ izstrādājot cilvēka prāta modeļus un implementējot tos datorsimulācijās, nākas sastapties ar vairākiem nopietniem izaicinājumiem. Šai rakstā tiek identificēti četri galvenie izaicinājumi. Pirmais izaicinājums ir, ka cilvēki ir emocionālas būtnes. Tādēļ modelētājam ir jāņem vērā un jāiestrādā savā modelī ne tikai loģiskie spriešanas procesi, kas noris cilvēka prātā, bet arī šķietami neracionālie emocionālie procesi. Otrs izaicinājums ir, ka cilvēkiem ir sarežģīti iekšējie stāvokļi, kas sastāv no dažādiem mainīgajiem un kopā veido indivīda personību. Indivīda personība ietekmē, kā indivīds uztver pasauli un darbojas. Un pasaulē neeksistē divi indivīdi ar pilnīgi vienādām personībām. Tādēļ arī mākslīgajā cilvēkiem līdzīgu aģentu pasaulē nebūs aģenti ar pilnīgi vienādām personības vērtībām. Trešais izaicinājums ir, ka indivīda personība mainās laika gaitā – tā ir dinamiska. Līdz ar indivīda pieredzi un adaptēšanos, arī viņa personība mainās un attīstās. Ceturtais izaicinājums, ar ko nākas sastapties modelētājam ir, ka cilvēki neeksistē izolēti viens no otra, bet gan sabiedrībā. Sabiedrībai ir liela ietekme uz indivīdu, viņa pārliecībai, vērtībām, izpratnei un tml. Un no otras puses, indivīds ietekmē konkrēto sabiedrību, kurā viņš eksistē. Tas nozīmē, ka modelētājam ir jāmodelē ne tikai viena indivīda prāta funkciju un procesu savstarpējo saišu tīkls, bet drīzāk tīklu tīkls, kas formālā veidā attēlo, kā indivīdi ir saistīti sabiedrības grupas ietvaros un kā tiek ietekmē viens otru un veido funkcionējošu sabiedrību.